Characterization of the ruminal microbiota of lambs at the taxonomic level of genus under diets with garlic and rosemary essential oils

Abstract

A microbiota ruminal é um componente importante na digestão de nutrientes em ruminantes e pode ser modulada por aditivos naturais com ação antimicrobiana seletiva, como os óleos essenciais. Este estudo teve como objetivo caracterizar a microbiota ruminal de cordeiros confinados, em nível taxonômico de gênero, submetidos a dietas contendo diferentes doses de óleos essenciais de alho e alecrim. Foram utilizados 35 cordeiros machos, não castrados, cruzados Texel × Dorper × Santa Inês, alocados em cinco tratamentos dietéticos: dieta controle (sem aditivo), duas doses de óleo essencial de alho (0,14 e 1,00 mL/L) e duas de alecrim (0,40 e 1,00 mL/L), durante 90 dias de confinamento. As amostras de líquido ruminal foram submetidas à extração de DNA e sequenciamento da região V3–V4 do gene 16S rRNA para análise da composição bacteriana. Em todas as dietas, Prevotella foi o gênero predominante, especialmente na dieta controle, sendo reduzido nos grupos suplementados com óleos essenciais. A dieta com 0,40 mL/L de alecrim promoveu maior abundância de Fibrobacter, um gênero celulolítico chave, além de aumentar a presença das arqueas Methanobrevibacter e Methanomassiliicoccus. Apesar do aumento na população metanogênica, a relação Fibrobacter/arqueas foi mais equilibrada, indicando um ambiente ruminal potencialmente mais eficiente em termos de degradação de fibras e menor perda energética. Os índices de diversidade alfa (Shannon, Simpson e Chao) não diferiram significativamente entre as dietas (p > 0,05), mas a composição da microbiota foi qualitativamente modulada. Conclui-se que o óleo essencial de alecrim, na dose de 0,40 mL/L, exerce efeito benéfico sobre a estrutura da microbiota ruminal, favorecendo microrganismos relacionados à digestão de fibra e maior eficiência fermentativa em cordeiros confinados.